Esses dois comandinhos são usados pelo gitlab na otimização de repositórios:
git repack git gc
De acordo com o manual:
git-repack(1) Pack unpacked objects in a repository. git-gc(1) Cleanup unnecessary files and optimize the local repository.
Em um repositorio grande fez bastante diferença
2,3G repo-arquivos # antes 1,4G repo-arquivos # depois
